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《内蒙古医学杂志》（CN 15-1101/R ISSN 1004-0951）是内蒙古自治区医疗卫生综合性科技期刊。1954年创刊，原名《内蒙古卫生通讯》，蒙、汉文版，双月刊。1957年改名为《内蒙古卫生》，月刊，1966年“文化大革命”开始后停刊。1981年复刊（汉文版），季刊。1987年公开发行。1995年改为双月刊。2004年改为月刊。
1953年初，内蒙古自治区成立了卫生宣传队，该队1954年创办了蒙汉文版的《内蒙古卫生通信》，双月刊，是《内蒙古医学杂志》的前身。当时的主要任务是传达党和卫生工作方针、政策；布置卫生工作任务和要求；交流各地卫生工作经验；根据卫生干部业务学习规划，刊登业务学习材料。
1957年下半年，内蒙古自治区卫生宣传队改为内蒙古自治区卫生宣传室，仍为内蒙古自治区卫生厅下属事业单位。同时，将《内蒙古卫生通讯》改名为《内蒙古卫生》，月刊。《内蒙古卫生》除继续刊载卫生方针政策外，主要刊登学术性文章，为广大卫生科技工作者提供学术交流的园地。1966年“文化大革命”开始后停刊。
1980年，筹建内蒙古自治区医学科学院的同时，着手《内蒙古卫生》复刊事宜，组建了编辑委员会和编辑部；1981年正式复刊，刊名为《内蒙古医学杂志》，一直延续至今。此后，随着全区卫生事业和医学科技事业的迅速发展，刊出内容亦作了相应的调整，主要刊登医学科技论文，辅以有关学术交流情况、重大会议报道等新闻性文章。1985年上半年，内蒙古自治区医学科学院撤销，编辑部划归卫生厅新组建的宣传情报研究室。1988年上半年，在卫生厅宣传情报研究室的基础上，成立了内蒙古自治区科学技术情报研究所，《内蒙古医学杂志》编辑部脱离内蒙古自治区科学技术情报研究所，挂靠卫生厅医学科研教育处。1988年12月，卫生厅将《内蒙古医学杂志》、《内蒙古中医药》、《蒙医药》、《内蒙古地方病防治研究》四个编辑部联合成立了内蒙古医学杂志社，仍挂靠厅科教处。杂志社不是独立法人单位，各编辑部仍按隶属关系独立办公，编辑出版各自的杂志。
1996年12月，内蒙古自治区编委以“内机编发〔1996〕99号”文批准内蒙古医学杂志社成为直属卫生厅的独立事业法人单位，主办《内蒙古医学杂志》。
2005年12月，内蒙古医学杂志社和内蒙古自治区医学会合并，仍为内蒙古自治区卫生厅直属事业单位，李玉成任内蒙古医学会秘书长兼内蒙古医学杂志社社长。内蒙古自治区医学会和内蒙古医学杂志社的成功合并，使全区卫生系统的继续医学教育、学术活动、科技论文的发表有机地结合在了一起，学会工作和杂志工作互为促进，步入良性发展的轨道。
《内蒙古医学杂志》从1954年创刊以来，历经风雨，经历了创刊、停刊、复刊；由行政性内容为主到行政、科技内容兼有，直至完全刊登综合性医学科技内容。由季刊到双月刊、再到月刊，逐步壮大。至2005年底，共刊出（包括增刊）340期。1981年复刊后，刊发科技论文20 312篇。屡获内蒙古自治区、华北地区、全国优秀科技期刊荣誉称号，是中国学术期刊综合评价数据库来源期刊。万方数据—数字化期刊群全文上网期刊，中国核心期刊（遴选）数据库、中国期刊网和中国学术期刊（光盘版）、中国期刊全文数据库（CJFD）、中外科技期刊数据库、《中国生物学文摘》和中国生物学文献数据库收录期刊。
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